डॉ दूबे वर्ष 1989 से 2001 तक बिरसा कृषि विश्वविद्यालय में सहायक प्राध्यापक एवं एसोसिएट प्रोफेसर के रूप में कार्य कर चुके हैं। बाद में वह आईसीएआर, नई दिल्ली चले गए थे। वहां उन्होंने वरीय वैज्ञानिक, प्रधान वैज्ञानिक, विभागाध्यक्ष, निदेशक और सहायक महानिदेशक के रूप में कार्य किया। पौधा और कवक रोगों का प्रबंधन एवं निदान उनके शोध का प्रमुख क्षेत्र रहा है। देश-विदेश के प्रतिष्ठित रिसर्च जर्नल में उनके 200 से अधिक शोध पत्र प्रकाशित हैं।